转录组测序仪 (纳米孔单分子测序系统)
转录组测序仪 (纳米孔单分子测序系统)
仪器编号
25000256
规格
PromethION 2
生产厂家
LOMZA
型号
PromethION 2
制造国家
英国
购置日期
2023-10-16
放置地点
出厂日期
2023-10-17

主要规格及技术指标

2.1 测序原理:以单分子 DNA/RNA 通过生物纳米孔的电流变化推测碱基组成而进行实时测序,通过电信号转化进行测序而非化学信号。
2.2 测序过程:无需 PCR 扩增,无需荧光标记。避免因 PCR 扩增偏好和荧光标记产生的偏离和原始样本的失真。
2.3测序类型:DNA、RNA 均可直接测序,RNA 也可反转录成 CDNA再进行测序,碱基甲基化修饰等可直接测序,无需亚硫酸氢盐处理。
2.4 测序速度:测序速度快,DNA 测序速度可达450bp/s。
2.5测序读长:测序读长最长≧4Mb,实际读长由文库质量和基因片段长度决定
2.6测序通量:同时测序纳米孔通道数量多至12000,单张芯片单次最高可达 290G数据量,且可分多次使用,可同时运行两张独立芯片,两张芯片单次运行最高可达580G数据量。
2.7测序时间:1分钟~64 小时,无固定运行时间。可根据需求随时停止测序。
2.8 数据质量:单碱基准确度高达 99%,一致性序列准确性可达到 99.99%,即 Q40质量。
2.9 测序芯片:同时测序纳米孔通道数量多至12000,芯片可清洗,能重复使用。
2.10设备体积:设备较小,轻便易搬运。
2.11数据分析:仪器自带高性能集成计算模块,实时碱基识别和存储数据,可快速提供测序结果供下游分析。
2.12可操作性:设备对实验环境要求低,无需复杂的配套设施,仪器操作和数据分析简单,硬件投入成本低。
实验参数
3.1 样本要求:可兼容血液、肺泡灌洗液、脑脊液、组织等多种样本类型,也可对人体、动植物、环境等多种来源途径的样本进行检测(核酸片段长度>100bp 均可进行测序)
3.2 测序起始量:核酸起始量 10pg-1ug,灵敏度高。
3.3文库构建:文库制备简单,最快 10 分钟可完成。可选多种文库制备试剂盒匹配不同需求,使用灵活
3.4试剂选择:可提供23 种不同通量的建库试剂盒
3.5基因检测类型:可检测多种基因突变类型,如单核酸多态性(SNPs)、碱基插入/缺失 (Indel)、拷贝数变异(CNVs)、基因融合、基因甲基化修饰等。
3.6临床通用性:可应用在感染宏基因组检测中的菌种鉴定及耐药分析、遗传性和肿瘤性疾病中的全基因测序、全外显子测序、靶向 panel 测序等多种应用领域,且均具有权威SCI文献支持其研究。
3.7 生信分析:实时进行原始电信号碱基读取(FAST5和FASTQ),标准的FASTQ/FAST5数据格式,适用于下游一系列超30种以上的生信分析工具,生信分析软件兼容性高,可完成原始电信号碱基读取(FAST5ToFASTQ)、数据质量控制(QC)、barcode拆分(Demultiplexing)、序列比对(Alignment)、基因组组装(Assembly)、宏基因组分析(Metagenomics)、扩增子分析(Amplicon)、测序错误校正(Error correction)、变异分析 (Variant calling) 、碱基修饰 (Base modification)
3.8质量要求:此设备开展的项目需获国家临检中心的室间质评合格证书。

主要附件及配置

主要功能及特色

公告名称 公告内容 发布日期

暂无收费标准